Forest plots basés sur des modèles de régresion

Forest plot basés sur des modèles de régression Table des matières Introduction aux forest plots Les graphiques en fôret, ou forest plots en anglais, sont des représentations graphiques, initialement employées pour visualiser les résultats de méta-analyses d’essais cliniques randomisés, puis de méta-analyses d’études observationnelles. Dans les deux cas, c’est-à-dire pour comparer les résultats issus de […]

Nettoyer les données sous R : 7 situations courantes

nettoyer ses données avec R

Nettoyer les données sous R : 7 situations courantes Image par mohamed Hassan de Pixabay Nettoyer des données est souvent une étape un peu casse-tête, dans laquelle on peut perdre beaucoup de temps. Dans cet article je vous présente quelques situations que je rencontre régulièrement et les solutions que j’emploie. Pour l’illustrer j’ai créé un […]

Comment automatiser une palette de couleurs RGB ?

palette de couleurs RGB

Comment automatiser votre palette de couleurs RGB ? Table des matières Lorsqu’on réalise une représentation graphique avec ggplot2, et que l’on souhaite employer des couleurs bien précises, généralement, soit on les nomme en toute lettre, soit on utilise leur code hexadécimal. Mais comment faire quand on ne dispose que des codes RGB ? Je vous […]

Faire une table one ultra facilement

Réalisez une table one ultra facilement

Faire une table one ultra facilement Il y a quelque temps, j’ai publié un article pour vous montrer comment réaliser une table descriptive, dite Table 1, avec le package Table1.  Cliquez ici pour accéder à l’article “Créer une table 1 avec R” Mais plusieurs lecteurs (et lectrices 😉 ) m’ont écrit pour me dire qu’ils […]

5 fonctions pour regrouper des modalités

5 fonctions pour regrouper des modalités Image par Free-Photos de Pixabay Lorsqu’on travaille avec des variables qualitatives, c’est-à-dire des variables considérées comme des factor dans R, cela peut être vraiment utile de savoir regrouper certaines modalités. Par exemple, plusieurs modalités d’une variable qualitative peuvent avoir des effectifs très faibles. Dans cette situation, cela peut avoir […]

Mémo sur les fonctions lapply, sapply, tapply, apply

Mémo des fonctions lapply, sapply, tapply, apply Image par Gerd Altmann de Pixabay Ces fonctions lapply, sapply, tapply et lapply permettent d’appliquer une fonction (mean, par exemple, pour calculer une moyenne) sur des données, de façon itérative. Autrement dit, elles font la même chose qu’une boucle for(), tout en ayant une syntaxe concise, puisque ça se […]

Personnalisez vos rapports pdf avec pagedreport

rapport pdf avec R

Personnalisez vos rapports en pdf avec pagedreport Cette semaine, j’ai testé le package pagedreport, développé par Thomas Vroylandt et David Keyes. La promesse de ce package,  c’est de nous permettre (nous qui ne maîtrisons ni le CSS ni LaTeX) de générer un rapport au format pdf, élégant et personnalisable, à partir d’un simple document Rmarkdown […]

Introduction aux séries temporelles

représentation des prévisions du nombre de patients hospitalisés à l'horizon une semaine

Introduction aux séries temporelles La semaine dernière, j’ai vu cet extrait d’une émission de télé dans laquelle Catherine Hill expliquait à des journalistes que pour évaluer la tendance de l’évolution du nombre de nouveaux cas de covid par jour, on ne pouvait pas représenter les oscillations quotidiennes pour faire ensuite simplement la différence entre un […]

Reporting automatique des analyses statistiques

reporting automatisé des analyses statistiques avec R

Obtenir un reporting automatique des analyses statistiques Image par mohamed Hassan de Pixabay Depuis quelque temps, j’entends régulièrement parler du package easystat. C’est un “super” package qui contient plusieurs petits packages (un peu comme tidyverse), mais ici pour “apprivoiser, discipliner et exploiter les statistiques R effrayantes et leurs modèles embêtants” (ce sont les développeurs du […]

Comment obtenir l’indice d’une ligne ?

obtenir l'indice de ligne

Comment obtenir l’indice d’une ligne ? Image par mohamed Hassan de Pixabay Lorsqu’on analyse des données, on a fréquemment besoin de déterminer les indices des lignes répondant à une certaine condition. On peut, par exemple, avoir besoin de connaître sur quelle ligne se trouve la valeur minimale d’une variable. Nous allons voir qu’il existe quelques […]