Versionner facilement vos scripts R avec git​

Versionner facilement vos scripts R avec git Travailler de manière reproductible est une compétence indispensable aujourd’hui. Et parmi l’ensemble des choses que l’on peut mettre facilement en place pour travailler de manière reproductible avec R et RStudio, il y a le versionnage de nos scripts, en local,  avec l’outil git. Le versionnage des scripts a […]

News et découvertes de mars 2022

News et découvertes de mars 2022 Voici la récap des news et découvertes qui ont attiré mon attention au cours du mois de mars. Je les ai regroupées en 5 thématiques : Biostatistiques, Recherche reproductible, Recherche clinique, Data et Utilisation de R en sociologie. Bonne lecture ! Table des matières Biostatistique De l’intérêt de visualiser […]

Débuter avec Shiny grâce à Rmarkdown

Débuter avec Shiny grâce à Rmarkdown Pour toutes celles et ceux qui maîtrisent Rmarkdown, et qui aimeraient bien, à présent, apprendre à utiliser shiny (pour créer de belles applications web) mais qui appréhendent l’apprentissage de cette nouvelle technologie, je vous conseille de commencer par utiliser Shiny dans RMarkdown ! Parce que oui, c’est possible d’intégrer […]

Comment ajouter des données sur un ggplot existant ?

Comment ajouter des données sur un ggplot existant ? C’est une question que l’on me pose fréquemment, notamment lors des formations que j’anime sur ggplot2. Pour aider un maximum d’entre vous, j’ai donc décidé d’écrire cet article pour vous montrer comment faire, assez simplement, avec deux approches différentes. Dans l’exemple ci-dessous, je copie le data […]

ANOVA non paramétrique à 2 facteurs ou le test de Scheirer-Ray-Hare

ANOVA non paramétrique à 2 facteurs ou le test de Scheirer-Ray-Hare Jusque très récemment, je ne savais pas qu’il existait une approche permettant de réaliser une ANOVA non paramétrique à deux facteurs. C’est un lecteur du blog (Philippe V.) qui me l’a fait découvrir. Cette alternative, c’est le test de Scheirer-Ray-Hare ; je n’en avais […]

STOP aux problèmes de format de date lors des imports

STOP aux problèmes de format de date lors des imports Vous avez une ou plusieurs variables contenant des dates (avec ou sans élément d’heures) dans votre fichier de données, et lorsque vous l’importez dans R, le format est perdu ? Pas de désespoir inutile ! Il existe une solution toute simple qui va vous permettre […]

News et découvertes de février 2022

News et découvertes de février 2022 Voici la récap des news et découvertes qui ont attiré mon attention au cours du mois de février. Elle est organisée 4 thèmes principaux : utilisation de R, Data visualisation, Biostatistiques et Data sciences.    Table des matières Utilisation de R Comment lire une page d’aide Si vous avez […]

Régression non paramétrique de Theil Sen

Régression non paramétrique de Theil Sen Table des matières Contexte La régression non paramétrique de Theil Sen est une alternative à la régression linéaire, qui peut notamment être employée en présence d’outliers. Pour rappel, la régression linéaire simple est un modèle mathématique, qui met en relation une variable réponse (Y) avec une variable explicative (X), […]

4 nouvelles astuces pour Rmarkdown

Rmarkdown : 4 nouvelles astuces ! Dans cet article, je vous partage 4 nouvelles astuces Rmarkdown, directement issues des questions de mes stagiaires, lors de ma formation “Rmarkdown niveau 1 -Réalisez vos premiers rapports automatisés” Table des matières Astuce 1 : Obtenir une version imprimable d’un rendu html (si vous n’avez pas le Rmd) Imaginons […]

Comment afficher automatiquement l’équation d’une droite sur un ggplot ?

Comment afficher automatiquement l’équation d’une droite sur un ggplot2 ? Lorsque j’anime des formations sur la réalisation de graphiques sous R avec le package ggplot2, je me sers du scatterplot pour expliquer le principe et le fonctionnement du package. Parmi les éléments que je montre, il y a la couche geom_smooth(), qui permet ultra rapidement […]