Rmarkdown niveau 1

Réalisez vos premiers rapports automatisés

(1 jour - 7 heures)

Apprenez à élaborer facilement et rapidement vos rapports d’analyse, rapports d’activité, documents de recherche et d’enseignement, avec le logiciel R.

Formation R markdown niveau 1

Rmarkdown un format de fichier, avec une extension.Rmd, qui s’utilise avec R, et qui permet de générer automatiquement et dynamiquement des documents, notamment des comptes-rendus d’analyse.

Concrètement, ça veut dire qu’en plus de vos commandes R (comme dans un script en extension .R) vous pouvez ajouter des titres, du texte, des images, des équations, etc…. Et en cliquant sur un petit bouton dans R Studio (celui avec une pelote), vous allez générer automatiquement un document, en html, word ou pdf, qui contiendra le code, les résultats du code (tables descriptives, graphiques etc…), vos titres, votre texte, vos images, etc…
Et vous pourrez aussi ajouter une numérotation automatique, une table des matières, etc…

C’est un format génial qui permet de beaucoup gagner en efficacité et en sérénité. Personnellement, je travaille exclusivement en R markdown.

Pour vous citer quelques avantages concrets :

  • vous inscrivez votre travail dans une démarche reproductible, puisque vous avez le code et le rendu du code ensemble, dans le même document, qui est généré de façon dynamique (si les données changent, alors le document change aussi)
  • vous ne perdez plus de temps à vous battre avec la mise en page sous Word, et vous pouvez enfin vous consacrer au contenu de votre analyse
  • si vous répétez vos analyses (tous les mois, ou sur différents sous groupes de données par exemple), vous pourrez automatiser une grande partie
  • vous ne vous arracherez plus les cheveux quand on vous dira “oups il y avait une erreur dans les données, je l’ai corrigé, mais il faudrait refaire l’analyse… pour dans deux heures !”
  • c’est un format de script très facile à apprendre (ça fonctionne avec des balises comme le html, mais en beaucoup plus simple)
    Vous pourrez aussi faire des slides (bye bye power point !), des dashboards, des blogs, des CV, des examens, etc….

De mon point de vue, travailler avec R sans Rmarkdown, c’est comme utiliser R sans R Studio : ça n’a pas de sens !

 

Quels sont les objectifs ?

  • Apprendre les bases du format Rmarkdown pour travailler avec R de manière reproductible.
  • Apprendre à générer des documents (TD, rapport d’analyse, projet d’article, etc.) automatiquement et dynamiquement.
  • Découvrir la création de scripts Rmarkdown paramétrés, afin de générer plus facilement des documents similaires, mais sous différentes conditions (zone géographique, espèce animale, période de temps, etc.)

A qui s'adresse cette formation ?

A toute personne travaillant avec des données, amener à partager son travail et/ou souhaitant automatiser et rendre dynamique ses rapports d’analyse.

Y'a t'il des prérequis ?

Il est nécessaire d’avoir une connaissance de base du logiciel R : savoir qu’il existe différentes class de données (numeric, factor character), savoir manipuler à minima les vecteurs et les data frame : création, extraction d’un élément, savoir importer des données, etc. Dans l’idéal, le participant a suivi la formation Bien Débuter avec R, ou atteint un niveau équivalent par la pratique.

Quels est le contenu ?

Introduction : principe de Rmarkdown, formats des sorties, organisation de son travail, génération d’un premier rappport, les différents éléments d’un fichier Rmd, l’éditeur de RStudio, les ressources.


Premiers éléments : gestion des parties texte, gestion des parties code, création de graphiques, gestion des tables, exécution du code, réglage des options.

Etoffer son document : numérotation des titres, tables des matières, insertion d’images, insertion de liens hypertexte, utiliser un élément de code dans le texte, la bibliographie.

Découverte des scripts paramétrés : principe, processus, exemple.

Comment se déroule la formation ?

Les formations se déroulent selon une alternance de théorie, puis de mise en pratique, ensemble en pas à pas, puis d’exercices à réaliser en autonomie.

 

Est-ce que vous pourrez utiliser vos données ?

Oui, bien sur ! Lors des exercices, vous pourrez employer vos données, si vous préférez. En revanche, a priori, aucune correction individuelle ne pourra alors être réalisée.

Quand auront lieu les prochaines sessions ?

  • planning en cours de réalisation

Quel est le tarif ?

Les frais dont de 450 euros HT (-10% dès 2 inscrits, -20% à partir de 3 inscrits).

Est-ce que le nombre de places est limité ?

Oui. Toutes les formations se déroulent en petit comité afin que tout le monde puisse prendre la parole et poser des questions. Le nombre de places est donc limité à 5 stagiaires. Et la formation a lieu à partir de 2 stagiaires.

Est-ce finançable par les OPCOs ?

Certaines sessions de cette formation sont portées par l’organisme de formation Data Value, qui est certifié Qaliopi. Lorsque cela est le cas, vous pourrez alors, sous certaines conditions, utiliser vos fonds de formation pour financer totalement cette formation, via vos OPCOs. En dehors de ces sessions, a priori, aucune prise en charge par les fonds de formation ne pourra avoir lieu. Les sessions portées par Data Value sont précisées dans la partie “Quand auront lieu les prochaines formation s?”

Comment s'inscrire ?

Pour vous inscrire, il suffit de télécharger le bulletin d’inscription et de me le retourner par mail à l’adresse claire@delladata.fr. Je vous ferai alors parvenir une convention de formation.

Une fois complété, merci me l’adresser (claire@delladata.fr), ou l’adresser directement à l’organisme de formation Data Value (formation@datavalue.fr)

Est-ce que l'on peut l'organiser en intra ?

Cette formation peut être réalisée en intra-entreprise, intra-laboratoire, ou intra-faculté, en distanciel ou en présentiel, selon vos besoins et vos préférences.

Pour cela, il faut que nous en discutions plus en détail par téléphone. Envoyez-moi un message à claire@delladata.fr, pour fixer un rendez-vous.

Qu'est-ce que les stagiaires en disent ?

Vous avez d'autres questions ?

Pour toute question, contactez-moi : claire@delladata.fr

Une question ? Un besoin spécifique ?

N'hésitez pas !

Contactez moi pour me décrire vos besoins de formations à R et en biostatistiques

Qu'est-ce que les stagiaires en disent ?