Biostatistiques appliquées - Niveau 2

Modélisation statistique et analyses multivariées avec Jamovi / Jasp

Cette formation biostatistique avec Jamovi de niveau 2 est une formation de 3 jours pour approfondir ses compétences en biostatistiques, maîtriser les principales méthodes de modélisation statistique et découvrir les analyses multivariées.

Il s’agit d’une formation appliquée en biostatistiques, orientée vers le choix des méthodes, leur mise en œuvre pratique et l’interprétation des résultats, avec un minimum de formalisme mathématique.

Jamovi est un logiciel libre et intuitif, basé sur une interface graphique, qui permet de réaliser des analyses statistiques avancées sans programmation. Les concepts et méthodes abordés dans la formation sont également transposables à des logiciels équivalents comme JASP.

A qui s'adresse cette formation ?

Cette formation s’adresse aux professionnels de la santé, de la recherche et des sciences du vivant qui maîtrisent les fondamentaux de la biostatistique et souhaitent approfondir leurs compétences en modélisation statistique et en analyses multivariées.

Elle est particulièrement adaptée aux :

  • Chercheurs, enseignants-chercheurs, doctorants et post-doctorants.

  • Professionnels de santé et de la recherche clinique.

  • Ingénieurs, techniciens, chargés d’études et analystes de données.

  • Toute personne amenée à réaliser ou interpréter des analyses statistiques avancées dans le cadre de ses activités professionnelles ou de ses travaux de recherche.

Cette formation constitue un prolongement de la formation de niveau 1, sans qu’il soit nécessaire de l’avoir suivie si les prérequis sont maîtrisés.

Aucune connaissance en programmation n’est nécessaire, les analyses étant réalisées à l’aide de logiciels à interface graphique comme Jamovi et JASP.

Ce que cette formation n'est pas

Cette formation n’a pas vocation à :

  • Reprendre les notions fondamentales de statistique descriptive et inférentielle, considérées comme acquises.

  • Présenter de manière exhaustive l’ensemble des méthodes de modélisation statistique et d’analyse multivariée.

  • Proposer un enseignement théorique approfondi des fondements mathématiques des modèles statistiques.

  • Fournir des procédures d’analyse automatiques sans réflexion sur le choix des méthodes, leurs conditions d’application et l’interprétation des résultats.

Elle privilégie une approche pratique et raisonnée des méthodes statistiques, afin de permettre aux participants de comprendre les modèles, de les mettre en œuvre avec Jamovi et JASP et d’interpréter leurs résultats dans un contexte scientifique.

Prérequis

Les participants doivent maîtriser les notions fondamentales de statistique descriptive et inférentielle, notamment :

  • Les principaux tests de comparaison de moyennes et de proportions.
  • L’ANOVA à un facteur.
  • La corrélation et la régression linéaire simple.
  • L’interprétation des valeurs p et des intervalles de confiance.
  • Les principes généraux des tests statistiques et leurs conditions d’application.

 

Aucune connaissance préalable des logiciels Jamovi ou JASP n’est requise.

La maîtrise des modèles statistiques étudiés au cours de la formation ne constitue pas un prérequis.

Objectifs et compétences visées

Cette formation vise à permettre aux participant(e)s de comprendre, choisir, mettre en œuvre et interpréter les principales méthodes de modélisation statistique et d’analyse multivariée utilisées en recherche.

À l’issue de la formation, les participant(e)s seront capables de :

  • Identifier les situations nécessitant une modélisation statistique et comprendre les principes de l’ajustement.

  • Choisir un modèle adapté à la nature de la variable réponse et à la question scientifique.

  • Réaliser et interpréter une ANOVA factorielle et une ANCOVA.

  • Construire et interpréter des modèles de régression linéaire multiple, logistique et de Poisson.

  • Vérifier les principales hypothèses et conditions d’application des modèles.

  • Évaluer les performances discriminantes d’un modèle logistique à l’aide d’une courbe ROC.

  • Réaliser et interpréter une analyse de survie avec Kaplan-Meier et le modèle de Cox.

  • Analyser des données répétées et identifier les situations nécessitant des modèles mixtes.

  • Réaliser et interpréter une analyse en composantes principales (ACP).

  • Mettre en œuvre une classification ascendante hiérarchique (CAH) et interpréter les groupes obtenus.

Ces compétences permettront aux participants de mieux justifier leurs choix méthodologiques, d’analyser des données complexes et de présenter des résultats statistiques pertinents dans un contexte scientifique ou professionnel.

Ces compétences permettent de sécuriser les analyses statistiques, de mieux justifier les choix méthodologiques et de produire des résultats interprétables et exploitables dans un cadre professionnel.

Programme détaillé

 

Module 1 – Comprendre les principes de la modélisation statistique

Objectif : comprendre l’intérêt de la modélisation pour étudier simultanément plusieurs variables et prendre en compte les facteurs de confusion.

  • Limites des analyses bivariées.

  • Variables réponses et variables explicatives.

  • Variables de confusion et ajustement statistique.

  • Principes généraux des modèles statistiques.

  • Choix d’un modèle selon la nature de la variable réponse.

Module 2 – ANOVA factorielle et ANCOVA

Objectif : analyser l’effet de plusieurs facteurs sur une variable quantitative et prendre en compte une covariable.

  • ANOVA à deux facteurs.

  • Effets principaux et interactions.

  • Analyse de covariance (ANCOVA).

  • Ajustement sur une covariable quantitative.

  • Interprétation des résultats et représentations graphiques.

  • Applications pratiques sous Jamovi (ou Jasp).

Module 3 – Régression linéaire multiple

Objectif : construire et interpréter un modèle permettant d’étudier l’association entre une variable quantitative et plusieurs variables explicatives.

  • Construction d’un modèle de régression linéaire multiple.

  • Variables explicatives quantitatives et qualitatives.

  • Variables indicatrices et catégories de référence.

  • Interprétation des coefficients et des intervalles de confiance.

  • Prise en compte des interactions.

  • Vérification des hypothèses et diagnostic du modèle.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp)

Module 4 – Régression logistique et courbes ROC

Objectif : modéliser la probabilité de survenue d’un événement binaire et évaluer les performances discriminantes du modèle.

  • Principes de la régression logistique.

  • Construction d’un modèle de régression logistique multiple.

  • Odds ratios bruts et ajustés.

  • Interprétation des coefficients et des probabilités prédites.

  • Utilisation des probabilités prédites pour la classification.

  • Sensibilité, spécificité et choix d’un seuil de classification.

  • Courbes ROC et aire sous la courbe (AUC).

  • Applications pratiques sous Jmovi (Jasp).

Module 5 – Régression de Poisson

Objectif : comprendre et mettre en œuvre un modèle adapté à l’analyse des données de comptage et des taux d’incidence.

  • Principes de la régression de Poisson.

  • Construction et interprétation du modèle.

  • Rapports de taux et intervalles de confiance.

  • Prise en compte du temps d’exposition.

  • Notion de surdispersion et limites du modèle.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp).

Module 6 – Analyse de survie

Objectif : analyser le délai de survenue d’un événement et étudier l’association entre plusieurs facteurs et le risque de survenue.

  • Particularités des données de survie et notion de censure.

  • Estimation et interprétation des courbes de Kaplan-Meier.

  • Comparaison des courbes de survie par le test du log-rank.

  • Principes du modèle de régression de Cox.

  • Interprétation des hazard ratios bruts et ajustés.

  • Introduction à l’hypothèse des risques proportionnels.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp).

Module 7 – Analyser des données répétées

Objectif : comprendre les particularités des données longitudinales et choisir une approche adaptée à la dépendance entre observations.

  • Particularités des données répétées et longitudinales.

  • ANOVA à mesures répétées.

  • Vérification des hypothèses, notamment la sphéricité.

  • Alternatives non paramétriques.

  • Introduction aux modèles mixtes et à leurs situations d’utilisation.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp).

Module 8 – Analyse en composantes principales (ACP)

Objectif : explorer des données multidimensionnelles, réduire le nombre de dimensions et interpréter les principales structures observées.

  • Objectifs et principes de l’ACP.

  • Réduction de dimension et synthèse de l’information.

  • Valeurs propres, variance expliquée et choix des axes.

  • Cercle des corrélations et représentation des variables.

  • Projection des individus sur les axes factoriels.

  • Contributions et qualité de représentation.

  • Interprétation des résultats.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp).

Module 9 – Classification et clustering

Objectif : identifier des groupes d’individus présentant des caractéristiques similaires et interpréter les classifications obtenues.

  • Principes de la classification non supervisée.

  • Notions de distance et de similarité entre individus.

  • Classification ascendante hiérarchique (CAH).

  • Construction et interprétation d’un dendrogramme.

  • Choix du nombre de classes.

  • Caractérisation des groupes obtenus.

  • Complémentarité entre ACP et classification.

  • Applications pratiques sous Jamovi (Jasp).

Utilisation raisonnée de l’intelligence artificielle

Tout au long de la formation, des outils d’intelligence artificielle peuvent être mobilisés comme supports pédagogiques pour faciliter la compréhension des méthodes statistiques, accompagner le choix des analyses, expliquer les résultats et identifier les erreurs potentielles d’interprétation.

Une attention particulière est portée aux limites de ces outils, notamment dans le choix des modèles, la vérification de leurs hypothèses et l’interprétation des résultats.

L’intelligence artificielle est utilisée comme une aide au raisonnement statistique, et non comme un substitut à l’expertise méthodologique.

Pour les facultés et établissements d’enseignement supérieur, des formats spécifiques sur deux jours peuvent être proposés,

Modalités pratiques

⏱️ Durée

3 jours (21 heures)

💻 Format

Distanciel (visioconférence)
Présentiel possible selon les besoins 
Formation proposée en inter ou en intra-entreprise

👥 Effectif

Groupes à taille limitée (environ 5), favorisant les échanges et les questions

🏷️ Tarif

1 650 € HT par participant(e) pour la formation de 3 jours (21 h) – Supports pédagogiques inclus. 

Les tarifs en intra-entreprise sont établis sur devis, en fonction du format et des modalités de la formation.

Organisme exonéré de TVA  en vertu de l’article 261-4-4°a du CGI

📘 Pédagogie et supports

Alternance d’apports théoriques et de mises en pratique
Supports et script R commentés remis aux participant(e)s
Temps dédiés aux questions et à l’interprétation

🧰 Logiciels

Jamovi et Jasp

📝 Evaluation des acquis

Exercices pratiques, mises en situation et échanges oraux tout au long de la formation.

.

✔️ Suivi et assiduité

Émargement par demi-journée.

⚙️ Adaptation et accessibilité

Les exemples peuvent être adaptés au contexte des participants en intra-entreprise.

Toute situation de handicap ou besoin spécifique peut être signalé en amont afin d’étudier les adaptations possibles.


📅 Prochaine session

 Session inter-entreprise (distanciel) :

 

S'inscrire à la formation

Cette formation est proposée en inter-entreprise (inscription individuelle) ou en intra-entreprise (formation sur mesure pour une organisation).

  • Pour une inscription individuelle en inter-entreprise, vous pouvez demander le formulaire d’inscription.

  • Pour une formation intra-entreprise, un devis personnalisé est établi sur demande.

Et après la formation ?

Vous souhaitez un coup de pouce pour appliquer ce que vous avez appris à vos propres données ? Je propose des forfaits d’accompagnement R & biostatistiques pour vous épauler sur vos premiers projets : relecture de scripts, mise en place de rapports Quarto, soutien méthodologique ponctuel.

Forfaits de 1h à 50h, mutualisables au sein de votre structure, valables 1 an.

→ Découvrir l’accompagnement post-formation

Informations pratiques et programmes

FAQ

L’organisme de formation DellaDATA n’est pas certifié QUALIOPI.

À ce titre, il n’est pas possible de mobiliser directement des fonds de formation pour la prise en charge des frais, notamment dans le cadre d’une inscription individuelle en inter-entreprise.

En revanche, cette formation est régulièrement mutualisée avec des organismes de formation partenaires certifiés QUALIOPI.

Selon le contexte, notamment lorsqu’elle est intégrée à un dispositif porté par un organisme partenaire, une prise en charge par les OPCO peut être envisagée.

Les modalités de financement dépendant de la situation, je vous invite à me contacter en amont afin d’échanger sur les solutions possibles.

Organisme de formation : DellaDATA

  • NDA: 93040100204 auprès du préfet de région PACA
  • SIRET : 90838795400013
  • Organisme exonéré de TVA en vertu de l’article 261-4-4°a du CGI
  • Adresse : 1087 ch de Ste Roustagne – 04100 Manosque
  • Formatrice et interlocutrice : Claire Della Vedova (claire@delladata.fr / 06.64.98.21.42)
  • Blog : https://delladata.fr/blog/

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