Modélisation dose réponse

Modélisation dose réponse Introduction à la modélisation dose réponse La modélisation dose réponse consiste à modéliser, à l’aide d’une équation mathématique, l’évolution d’une réponse (la taille de racines de plantes par exemple) en fonction de l’augmentation de la dose d’un élément étudié (un herbicide par exemple). Pour réaliser une modélisation dose réponse, il est nécessaire […]

La régression logistique par l’exemple

tracé des battement du coeur

La régression logistique par l’exemple Prérequis Dans cet article, nous allons voir comment réaliser, en pratique, une régression logistique avec le logiciel R. Pour tirer pleinement profit de cet article, je vous recommande de lire l’article d’introduction à la régression logistique. Cliquez ici pour accéder à l’article d’introduction à la régression logistique Les données pour […]

Introduction à la régression logistique

courbe sigmoide

Introduction à la régression logistique Prérequis Pour tirer pleinement profit ce cet article, il est nécessaire d’avoir quelques notions au sujet des Modèles Linéaires Généralisés (GLM). Si cela n’est pas le cas, je vous recommande la lecture de l’article “Introduction aux GLM” . Introduction La régression logistique est une approche statistique qui peut être employée pour évaluer et […]

Tutoriel : ANOVA sur mesures répétées

Tutoriel : ANOVA sur mesures répétées L’ANOVA paramétrique à un facteur est une approche statistique qui permet de comparer plus de deux moyennes. Mais, pour être valide, cette méthode doit satisfaire trois critères : indépendance des résidus (ou des données) normalité des résidus (ou des données) homogénéité des résidus (ou des données).  Lorsque l’hypothèse de normalité et/ou d’homogénéité n’est […]

Calculer et rapporter les odds ratio sans se fatiguer !

calculer et rapporter les odds ratio

Calculer et rapporter les odds ratio sans se fatiguer Très récemment, j’ai travaillé sur la construction d’un score prédictif dans le domaine médical. Il s’agissait de construire un outil d’aide au pronostic de mauvaise réponse à un traitement donné, à l’aide d’une dizaine de variables prédictives. La méthodologie classiquement employée consiste, à : Catégoriser chaque variable prédictive […]

ANOVA à 2 facteurs – quand les hypothèses ne sont pas satisfaites

ANOVA à 2 facteurs : quand les hypothèses ne sont pas satisfaites Cet article fait suite aux trois précédents articles consacrés à l’ ANOVA à 2 facteurs (two ways anova, en anglais) : Introduction à l’ANOVA à 2 facteurs ANOVA à 2 facteurs : principe ANOVA à 2 facteurs avec R : Tutoriel   Nous allons voir […]

Introduction aux GLMM avec données de proportion

GLMM logiciel R pourcentages

Introduction aux GLMM avec données de proportion Pour faire suite au tutoriel sur les GLM avec données de comptage, et pour répondre aux demandes de certains d’entre vous, je vous propose ici une introduction aux GLMM avec données de proportion, sous la forme d’un petit tutoriel. Les GLMM (pour Generalized Linear Mixed Models) sont des modèles linéaires généralisés à effets […]

Tutoriel : GLM sur données de comptage (régression de Poisson) avec R

glm données de comptage logiciel R

Tutoriel : GLM sur données de comptage (régression de Poisson) avec R Les GLM (modèles linéaires généralisés) sur données de comptage, ou régression de Poisson, sont des approches statistiques qui doivent être employées lorsque la variable à analyser résulte d’un processus de comptage (comme un nombre d’œufs pondus, un nombre de buts marqués, ou encore un nombre de visites sur un site […]

ANOVA à 2 facteurs avec R : Tutoriel

tuto anova avec r

ANOVA à 2 facteurs avec R : Tutoriel Ce tutoriel dédié à la réalisation d’ANOVA à deux facteurs avec le logiciel R, fait suite à deux premiers articles consacrés à cette approche statistique, l’un d’introduction, l’autre détaillant son fonctionnement. En lisant ce tutoriel vous apprendrez : comment explorer vos données, comment réaliser une ANOVA à deux facteurs, […]

ANOVA à 2 facteurs : principe

anova avec R

ANOVA à 2 facteurs : principe Dans l’article d’introduction à l’ANOVA à 2 facteurs, nous avons vu que le principe de cette approche consiste, dans un premier temps, à décomposer la dispersion totale des données, en quatre origines : la part imputable au premier facteur, la part imputable au second facteur, la part imputable à l‘interaction des 2 facteurs, la part […]